O Marajó conta com 16 municípios, sendo que a Ilha do Marajó é formada por 12 deles: Soure, Salvaterra, Chaves, Afuá, Ponta de Pedras, Cachoeira do Arari, Santa Cruz do Arari, Muaná, Breves, Curralinho, Anajás, e São Sebastião da Boa Vista. No arquipélago do Marajó, incluem-se mais os municípios de Portel, Gurupá, Melgaço e Bagre.